解决DESeqDataSetFromMatrix Error: $ operator is invalid for atomic vectors

📅 发布时间:2026/7/5 0:59:43 👁️ 浏览次数:
解决DESeqDataSetFromMatrix Error: $ operator is invalid for atomic vectors
背景说明粉丝的问题如下:我正在尝试使用 DESeq2 进行差异基因表达分析,计数数据来自 kallisto。我使用 tximport 导入了数据,并使用 DESeqDataSetFromMatrix 函数创建了 DESeqDataSet (dds)。dds- DESeqDataSetFromMatrix(counts, samples, ~ strain + batch)然后我得到了以下错误,这在我的实验设计下是预期的:ErrorincheckFullRank(modelMatrix):the model matrix is not full rank, so the model cannot be f