解决c++ bam terminate called after throwing an instance of ‘seqan::UnknownExtensionError‘
背景说明粉丝的问题如下：我正在尝试在 C++ 中打开 .bam 文件，以提取特定 scaffold 和位点上的 reads。我本质上想在 C++ 中调用 “samtools view sample.bam -o sample.sam scaffold:pos-pos”。我尝试了 system(“samtools view sample.bam -o sample.sam scaffold:pos-pos”)，但遇到了一些问题（如有需要可以详细说明，为简洁起见，此处省略）。因此，我转向使用 SeqAn。当我运行脚本时，出现以下错误：terminate called after throwing an instance of'seqan::UnknownExtensionError'what(): Unknownfileextension of copyPolly_SRR6511930.bam: iostream error我在所在机构的超级计算机集群（Texas AM Terra 集群）上运行程序，没有 sudo 权限。我已经加载了以下模块：GCC/9.3.0 SeqAn/2.4.0-GCCcore-9.3.0 zlib/1
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