人类基因组中只有1.5%的序列是蛋白编码序列【1】。其余的序列对基因在细胞发挥发育和行为的合适功能起至关重要的作用【2】。解析转录过程的分子细节是我们理解人类发育和人类疾病分子机制的基础。目前我们对分子细节的理解仍然在停留假设阶段而且理解的十分有限。比如如下这些疑问尚未得到完全解决1每个基因的转录调控序列是哪些2哪些顺式调控序列控制了基因的特异表达3哪些表观信息在发育过程中得到储存和遗传这些表观信息如何控制基因的表达第一个科学问题目前在人类基因组研究中取得了很大的进展目前在人类的1518个细胞系中发现了1,063,878条顺式调控序列https://screen.encodeproject.org。但是确定特定基因表达相关的顺式元件这个进展不大【3】。目前解析enhancer与promoter关系的实验方法是CRISPRi技术是通过将目标enhancer进行屏蔽进而弄清这个enhancer是否导致目标基因的表达变化【4】。参考文献1、International Human Genome Sequencing Consortium. Finishing the euchromatic sequence of the human genome.Nature431, no. 7011 (2004): 931-945.2、Feingold, E. A., P. J. Good, M. S. Guyer, S. Kamholz, L. Liefer, K. Wetterstrand, F. S. Collins et al. The ENCODE (ENCyclopedia of DNA elements) project.Science306, no. 5696 (2004): 636-640.3、He, Bing, Changya Chen, Li Teng, and Kai Tan. Global view of enhancer–promoter interactome in human cells.Proceedings of the National Academy of Sciences111, no. 21 (2014): E2191-E2199.4、Chen, Zhuoxin, Valentina Snetkova, Grace Bower, Sandra Jacinto, Benjamin Clock, Atrin Dizehchi, Iros Barozzi et al. Increased enhancer–promoter interactions during developmental enhancer activation in mammals.Nature genetics56, no. 4 (2024): 675-685.